Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY4Q4G0A6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY4Q4G0A6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY4Q4G0A6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MINDY4Q4G0A6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MINDY4Q4G0A6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MINDY4Q4G0A6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MINDY4Q4G0A6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MINDY4Q4G0A6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MINDY4Q4G0A6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MINDY4Q4G0A6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MINDY4Q4G0A6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MINDY4Q4G0A6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MINDY4Q4G0A6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MINDY4Q4G0A6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MINDY4Q4G0A6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MINDY4Q4G0A6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MINDY4Q4G0A6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MINDY4Q4G0A6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MINDY4Q4G0A6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MINDY4Q4G0A6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MINDY4Q4G0A6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MINDY4Q4G0A6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MINDY4Q4G0A6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MINDY4Q4G0A6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MINDY4Q4G0A6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MINDY4Q4G0A6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MINDY4Q4G0A6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MINDY4Q4G0A6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MINDY4Q4G0A6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MINDY4Q4G0A6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MINDY4Q4G0A6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MINDY4Q4G0A6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MINDY4Q4G0A6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MINDY4Q4G0A6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MINDY4Q4G0A6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MINDY4Q4G0A6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MINDY4Q4G0A6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MINDY4Q4G0A6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MINDY4Q4G0A6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MINDY4Q4G0A6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MINDY4Q4G0A6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MINDY4Q4G0A6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MINDY4Q4G0A6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MINDY4Q4G0A6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MINDY4Q4G0A6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MINDY4Q4G0A6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MINDY4Q4G0A6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MINDY4Q4G0A6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MINDY4Q4G0A6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MINDY4Q4G0A6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MINDY4Q4G0A6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MINDY4Q4G0A6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MINDY4Q4G0A6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms