Protein–RNA interactions for Protein: Q2M296

MTHFSD, Methenyltetrahydrofolate synthase domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSDQ2M296 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
MTHFSDQ2M296 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
MTHFSDQ2M296 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
MTHFSDQ2M296 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
MTHFSDQ2M296 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
MTHFSDQ2M296 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
MTHFSDQ2M296 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MTHFSDQ2M296 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
MTHFSDQ2M296 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
MTHFSDQ2M296 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
MTHFSDQ2M296 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
MTHFSDQ2M296 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
MTHFSDQ2M296 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MTHFSDQ2M296 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
MTHFSDQ2M296 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
MTHFSDQ2M296 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MTHFSDQ2M296 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MTHFSDQ2M296 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MTHFSDQ2M296 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MTHFSDQ2M296 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
MTHFSDQ2M296 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
MTHFSDQ2M296 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
MTHFSDQ2M296 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
MTHFSDQ2M296 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
MTHFSDQ2M296 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MTHFSDQ2M296 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
MTHFSDQ2M296 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
MTHFSDQ2M296 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
MTHFSDQ2M296 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
MTHFSDQ2M296 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MTHFSDQ2M296 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
MTHFSDQ2M296 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
MTHFSDQ2M296 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
MTHFSDQ2M296 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MTHFSDQ2M296 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
MTHFSDQ2M296 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MTHFSDQ2M296 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
MTHFSDQ2M296 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
MTHFSDQ2M296 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
MTHFSDQ2M296 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
MTHFSDQ2M296 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MTHFSDQ2M296 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MTHFSDQ2M296 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MTHFSDQ2M296 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
MTHFSDQ2M296 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MTHFSDQ2M296 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MTHFSDQ2M296 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
MTHFSDQ2M296 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
MTHFSDQ2M296 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MTHFSDQ2M296 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MTHFSDQ2M296 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MTHFSDQ2M296 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MTHFSDQ2M296 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MTHFSDQ2M296 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
MTHFSDQ2M296 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MTHFSDQ2M296 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MTHFSDQ2M296 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MTHFSDQ2M296 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MTHFSDQ2M296 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MTHFSDQ2M296 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
MTHFSDQ2M296 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MTHFSDQ2M296 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
MTHFSDQ2M296 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MTHFSDQ2M296 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MTHFSDQ2M296 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
MTHFSDQ2M296 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MTHFSDQ2M296 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MTHFSDQ2M296 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MTHFSDQ2M296 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MTHFSDQ2M296 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MTHFSDQ2M296 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MTHFSDQ2M296 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MTHFSDQ2M296 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MTHFSDQ2M296 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MTHFSDQ2M296 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MTHFSDQ2M296 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MTHFSDQ2M296 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MTHFSDQ2M296 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
MTHFSDQ2M296 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MTHFSDQ2M296 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MTHFSDQ2M296 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MTHFSDQ2M296 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms