Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDKN3Q16667 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDKN3Q16667 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKN3Q16667 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKN3Q16667 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CDKN3Q16667 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDKN3Q16667 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDKN3Q16667 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDKN3Q16667 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDKN3Q16667 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDKN3Q16667 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDKN3Q16667 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDKN3Q16667 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDKN3Q16667 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDKN3Q16667 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDKN3Q16667 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDKN3Q16667 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDKN3Q16667 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDKN3Q16667 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDKN3Q16667 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CDKN3Q16667 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDKN3Q16667 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDKN3Q16667 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDKN3Q16667 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDKN3Q16667 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDKN3Q16667 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDKN3Q16667 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDKN3Q16667 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDKN3Q16667 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDKN3Q16667 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDKN3Q16667 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDKN3Q16667 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDKN3Q16667 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDKN3Q16667 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDKN3Q16667 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDKN3Q16667 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDKN3Q16667 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDKN3Q16667 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDKN3Q16667 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDKN3Q16667 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDKN3Q16667 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKN3Q16667 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDKN3Q16667 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDKN3Q16667 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKN3Q16667 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKN3Q16667 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKN3Q16667 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKN3Q16667 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDKN3Q16667 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDKN3Q16667 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDKN3Q16667 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDKN3Q16667 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDKN3Q16667 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDKN3Q16667 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKN3Q16667 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKN3Q16667 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDKN3Q16667 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDKN3Q16667 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDKN3Q16667 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDKN3Q16667 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDKN3Q16667 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDKN3Q16667 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDKN3Q16667 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDKN3Q16667 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDKN3Q16667 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDKN3Q16667 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDKN3Q16667 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDKN3Q16667 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKN3Q16667 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKN3Q16667 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKN3Q16667 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKN3Q16667 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKN3Q16667 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDKN3Q16667 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDKN3Q16667 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKN3Q16667 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDKN3Q16667 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDKN3Q16667 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKN3Q16667 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKN3Q16667 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKN3Q16667 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKN3Q16667 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKN3Q16667 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKN3Q16667 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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