Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERC1Q15751 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERC1Q15751 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC1Q15751 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC1Q15751 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC1Q15751 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC1Q15751 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC1Q15751 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC1Q15751 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERC1Q15751 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC1Q15751 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERC1Q15751 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC1Q15751 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC1Q15751 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC1Q15751 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC1Q15751 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC1Q15751 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERC1Q15751 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC1Q15751 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC1Q15751 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC1Q15751 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC1Q15751 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC1Q15751 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC1Q15751 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERC1Q15751 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERC1Q15751 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC1Q15751 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC1Q15751 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HERC1Q15751 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HERC1Q15751 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC1Q15751 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC1Q15751 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERC1Q15751 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC1Q15751 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC1Q15751 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERC1Q15751 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC1Q15751 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERC1Q15751 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC1Q15751 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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