Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RAB3GAP1Q15042 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RAB3GAP1Q15042 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RAB3GAP1Q15042 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAB3GAP1Q15042 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RAB3GAP1Q15042 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RAB3GAP1Q15042 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAB3GAP1Q15042 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAB3GAP1Q15042 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAB3GAP1Q15042 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RAB3GAP1Q15042 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RAB3GAP1Q15042 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAB3GAP1Q15042 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RAB3GAP1Q15042 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAB3GAP1Q15042 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAB3GAP1Q15042 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RAB3GAP1Q15042 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAB3GAP1Q15042 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAB3GAP1Q15042 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP1Q15042 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAB3GAP1Q15042 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAB3GAP1Q15042 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAB3GAP1Q15042 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAB3GAP1Q15042 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAB3GAP1Q15042 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAB3GAP1Q15042 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAB3GAP1Q15042 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RAB3GAP1Q15042 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms