Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1orf61Q13536 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1orf61Q13536 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C1orf61Q13536 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C1orf61Q13536 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1orf61Q13536 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C1orf61Q13536 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1orf61Q13536 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1orf61Q13536 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1orf61Q13536 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1orf61Q13536 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1orf61Q13536 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1orf61Q13536 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1orf61Q13536 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C1orf61Q13536 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf61Q13536 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1orf61Q13536 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1orf61Q13536 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1orf61Q13536 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf61Q13536 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1orf61Q13536 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1orf61Q13536 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1orf61Q13536 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1orf61Q13536 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1orf61Q13536 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1orf61Q13536 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C1orf61Q13536 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C1orf61Q13536 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1orf61Q13536 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C1orf61Q13536 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1orf61Q13536 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1orf61Q13536 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1orf61Q13536 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1orf61Q13536 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1orf61Q13536 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C1orf61Q13536 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1orf61Q13536 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1orf61Q13536 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1orf61Q13536 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1orf61Q13536 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C1orf61Q13536 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C1orf61Q13536 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1orf61Q13536 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C1orf61Q13536 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C1orf61Q13536 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1orf61Q13536 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C1orf61Q13536 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C1orf61Q13536 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1orf61Q13536 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1orf61Q13536 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf61Q13536 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C1orf61Q13536 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C1orf61Q13536 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf61Q13536 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1orf61Q13536 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C1orf61Q13536 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C1orf61Q13536 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C1orf61Q13536 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1orf61Q13536 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1orf61Q13536 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C1orf61Q13536 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1orf61Q13536 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1orf61Q13536 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf61Q13536 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1orf61Q13536 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1orf61Q13536 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1orf61Q13536 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1orf61Q13536 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1orf61Q13536 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf61Q13536 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf61Q13536 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C1orf61Q13536 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.56■■■□□ 2
C1orf61Q13536 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C1orf61Q13536 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf61Q13536 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf61Q13536 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C1orf61Q13536 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf61Q13536 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf61Q13536 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1orf61Q13536 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1orf61Q13536 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms