Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CTSWP56202 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTSWP56202 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CTSWP56202 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CTSWP56202 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTSWP56202 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CTSWP56202 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CTSWP56202 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CTSWP56202 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CTSWP56202 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CTSWP56202 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CTSWP56202 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CTSWP56202 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTSWP56202 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CTSWP56202 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CTSWP56202 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CTSWP56202 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CTSWP56202 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CTSWP56202 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CTSWP56202 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CTSWP56202 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CTSWP56202 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CTSWP56202 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CTSWP56202 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CTSWP56202 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CTSWP56202 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CTSWP56202 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CTSWP56202 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CTSWP56202 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CTSWP56202 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CTSWP56202 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CTSWP56202 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CTSWP56202 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CTSWP56202 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CTSWP56202 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CTSWP56202 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CTSWP56202 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CTSWP56202 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTSWP56202 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CTSWP56202 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTSWP56202 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CTSWP56202 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTSWP56202 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTSWP56202 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CTSWP56202 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CTSWP56202 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CTSWP56202 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTSWP56202 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTSWP56202 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTSWP56202 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CTSWP56202 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CTSWP56202 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CTSWP56202 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CTSWP56202 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CTSWP56202 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTSWP56202 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTSWP56202 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTSWP56202 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTSWP56202 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTSWP56202 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTSWP56202 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CTSWP56202 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CTSWP56202 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CTSWP56202 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CTSWP56202 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CTSWP56202 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CTSWP56202 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CTSWP56202 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CTSWP56202 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CTSWP56202 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CTSWP56202 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CTSWP56202 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CTSWP56202 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CTSWP56202 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CTSWP56202 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CTSWP56202 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CTSWP56202 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CTSWP56202 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CTSWP56202 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CTSWP56202 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CTSWP56202 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CTSWP56202 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTSWP56202 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTSWP56202 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTSWP56202 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CTSWP56202 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CTSWP56202 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CTSWP56202 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CTSWP56202 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CTSWP56202 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CTSWP56202 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTSWP56202 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTSWP56202 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTSWP56202 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CTSWP56202 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CTSWP56202 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CTSWP56202 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CTSWP56202 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CTSWP56202 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTSWP56202 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms