Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMTP48728 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMTP48728 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMTP48728 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMTP48728 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMTP48728 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMTP48728 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMTP48728 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AMTP48728 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMTP48728 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AMTP48728 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AMTP48728 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMTP48728 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMTP48728 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMTP48728 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMTP48728 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMTP48728 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMTP48728 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMTP48728 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMTP48728 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMTP48728 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMTP48728 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AMTP48728 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMTP48728 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMTP48728 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMTP48728 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMTP48728 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMTP48728 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMTP48728 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMTP48728 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMTP48728 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMTP48728 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMTP48728 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMTP48728 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMTP48728 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMTP48728 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMTP48728 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMTP48728 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMTP48728 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMTP48728 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMTP48728 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMTP48728 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMTP48728 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMTP48728 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMTP48728 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMTP48728 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMTP48728 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMTP48728 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMTP48728 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMTP48728 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMTP48728 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AMTP48728 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AMTP48728 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMTP48728 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMTP48728 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMTP48728 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMTP48728 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMTP48728 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMTP48728 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMTP48728 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMTP48728 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMTP48728 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMTP48728 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMTP48728 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AMTP48728 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMTP48728 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMTP48728 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMTP48728 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMTP48728 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMTP48728 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMTP48728 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMTP48728 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMTP48728 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMTP48728 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMTP48728 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMTP48728 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMTP48728 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMTP48728 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMTP48728 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMTP48728 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMTP48728 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMTP48728 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMTP48728 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMTP48728 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMTP48728 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMTP48728 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMTP48728 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AMTP48728 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMTP48728 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AMTP48728 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMTP48728 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AMTP48728 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AMTP48728 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AMTP48728 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AMTP48728 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMTP48728 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMTP48728 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMTP48728 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMTP48728 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMTP48728 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms