Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RFX3P48380 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFX3P48380 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX3P48380 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX3P48380 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX3P48380 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX3P48380 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX3P48380 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX3P48380 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX3P48380 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX3P48380 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX3P48380 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFX3P48380 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFX3P48380 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFX3P48380 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFX3P48380 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFX3P48380 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFX3P48380 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFX3P48380 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFX3P48380 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFX3P48380 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFX3P48380 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFX3P48380 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFX3P48380 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX3P48380 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFX3P48380 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFX3P48380 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX3P48380 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX3P48380 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFX3P48380 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFX3P48380 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RFX3P48380 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX3P48380 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFX3P48380 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFX3P48380 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFX3P48380 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFX3P48380 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFX3P48380 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFX3P48380 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFX3P48380 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFX3P48380 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFX3P48380 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFX3P48380 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFX3P48380 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFX3P48380 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RFX3P48380 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFX3P48380 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFX3P48380 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RFX3P48380 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RFX3P48380 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFX3P48380 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX3P48380 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX3P48380 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX3P48380 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFX3P48380 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RFX3P48380 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFX3P48380 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFX3P48380 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFX3P48380 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFX3P48380 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFX3P48380 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX3P48380 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX3P48380 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX3P48380 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX3P48380 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX3P48380 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX3P48380 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX3P48380 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX3P48380 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX3P48380 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX3P48380 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX3P48380 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX3P48380 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX3P48380 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX3P48380 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX3P48380 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX3P48380 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX3P48380 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX3P48380 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX3P48380 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX3P48380 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX3P48380 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX3P48380 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFX3P48380 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFX3P48380 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX3P48380 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX3P48380 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX3P48380 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX3P48380 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX3P48380 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX3P48380 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX3P48380 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX3P48380 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX3P48380 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX3P48380 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX3P48380 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX3P48380 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX3P48380 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX3P48380 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX3P48380 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms