Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMI1P35226 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BMI1P35226 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BMI1P35226 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMI1P35226 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMI1P35226 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMI1P35226 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMI1P35226 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BMI1P35226 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMI1P35226 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMI1P35226 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMI1P35226 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMI1P35226 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMI1P35226 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BMI1P35226 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BMI1P35226 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMI1P35226 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BMI1P35226 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMI1P35226 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMI1P35226 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BMI1P35226 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BMI1P35226 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BMI1P35226 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BMI1P35226 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BMI1P35226 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BMI1P35226 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BMI1P35226 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMI1P35226 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMI1P35226 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMI1P35226 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMI1P35226 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMI1P35226 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMI1P35226 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BMI1P35226 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BMI1P35226 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMI1P35226 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMI1P35226 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMI1P35226 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMI1P35226 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMI1P35226 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMI1P35226 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMI1P35226 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMI1P35226 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BMI1P35226 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMI1P35226 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMI1P35226 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMI1P35226 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMI1P35226 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMI1P35226 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMI1P35226 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMI1P35226 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMI1P35226 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMI1P35226 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMI1P35226 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMI1P35226 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMI1P35226 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMI1P35226 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMI1P35226 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMI1P35226 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMI1P35226 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMI1P35226 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMI1P35226 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMI1P35226 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMI1P35226 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMI1P35226 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMI1P35226 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMI1P35226 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMI1P35226 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMI1P35226 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMI1P35226 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMI1P35226 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMI1P35226 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMI1P35226 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMI1P35226 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMI1P35226 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMI1P35226 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMI1P35226 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMI1P35226 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMI1P35226 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMI1P35226 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMI1P35226 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMI1P35226 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMI1P35226 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BMI1P35226 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMI1P35226 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMI1P35226 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMI1P35226 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMI1P35226 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMI1P35226 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMI1P35226 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMI1P35226 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMI1P35226 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMI1P35226 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMI1P35226 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMI1P35226 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMI1P35226 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMI1P35226 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMI1P35226 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMI1P35226 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BMI1P35226 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms