Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCND1P24385 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCND1P24385 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCND1P24385 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCND1P24385 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCND1P24385 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCND1P24385 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCND1P24385 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCND1P24385 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCND1P24385 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND1P24385 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND1P24385 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCND1P24385 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCND1P24385 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCND1P24385 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCND1P24385 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCND1P24385 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCND1P24385 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCND1P24385 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCND1P24385 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCND1P24385 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCND1P24385 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCND1P24385 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCND1P24385 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCND1P24385 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCND1P24385 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCND1P24385 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCND1P24385 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCND1P24385 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCND1P24385 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCND1P24385 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCND1P24385 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCND1P24385 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCND1P24385 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND1P24385 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND1P24385 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCND1P24385 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND1P24385 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCND1P24385 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCND1P24385 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCND1P24385 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCND1P24385 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCND1P24385 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCND1P24385 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCND1P24385 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCND1P24385 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCND1P24385 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCND1P24385 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCND1P24385 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCND1P24385 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCND1P24385 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND1P24385 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCND1P24385 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCND1P24385 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCND1P24385 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCND1P24385 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCND1P24385 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCND1P24385 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCND1P24385 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCND1P24385 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCND1P24385 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCND1P24385 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCND1P24385 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCND1P24385 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCND1P24385 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCND1P24385 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCND1P24385 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCND1P24385 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCND1P24385 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCND1P24385 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCND1P24385 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCND1P24385 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCND1P24385 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCND1P24385 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCND1P24385 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCND1P24385 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCND1P24385 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCND1P24385 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCND1P24385 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCND1P24385 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCND1P24385 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCND1P24385 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCND1P24385 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCND1P24385 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCND1P24385 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCND1P24385 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCND1P24385 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCND1P24385 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCND1P24385 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCND1P24385 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCND1P24385 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCND1P24385 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCND1P24385 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCND1P24385 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCND1P24385 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCND1P24385 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCND1P24385 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCND1P24385 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCND1P24385 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCND1P24385 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms