Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
S100A1P23297 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
S100A1P23297 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
S100A1P23297 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
S100A1P23297 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
S100A1P23297 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
S100A1P23297 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
S100A1P23297 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
S100A1P23297 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
S100A1P23297 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
S100A1P23297 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
S100A1P23297 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
S100A1P23297 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
S100A1P23297 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
S100A1P23297 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
S100A1P23297 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
S100A1P23297 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
S100A1P23297 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
S100A1P23297 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
S100A1P23297 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
S100A1P23297 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
S100A1P23297 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
S100A1P23297 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
S100A1P23297 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
S100A1P23297 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
S100A1P23297 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
S100A1P23297 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
S100A1P23297 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
S100A1P23297 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
S100A1P23297 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
S100A1P23297 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
S100A1P23297 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
S100A1P23297 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
S100A1P23297 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
S100A1P23297 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S100A1P23297 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S100A1P23297 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
S100A1P23297 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S100A1P23297 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
S100A1P23297 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
S100A1P23297 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
S100A1P23297 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
S100A1P23297 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
S100A1P23297 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
S100A1P23297 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
S100A1P23297 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S100A1P23297 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
S100A1P23297 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S100A1P23297 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S100A1P23297 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
S100A1P23297 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
S100A1P23297 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
S100A1P23297 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S100A1P23297 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
S100A1P23297 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S100A1P23297 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S100A1P23297 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S100A1P23297 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S100A1P23297 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S100A1P23297 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S100A1P23297 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S100A1P23297 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S100A1P23297 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S100A1P23297 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
S100A1P23297 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
S100A1P23297 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
S100A1P23297 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
S100A1P23297 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
S100A1P23297 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
S100A1P23297 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
S100A1P23297 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
S100A1P23297 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
S100A1P23297 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
S100A1P23297 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S100A1P23297 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
S100A1P23297 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
S100A1P23297 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
S100A1P23297 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
S100A1P23297 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
S100A1P23297 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
S100A1P23297 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
S100A1P23297 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
S100A1P23297 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
S100A1P23297 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
S100A1P23297 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
S100A1P23297 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S100A1P23297 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
S100A1P23297 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
S100A1P23297 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
S100A1P23297 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
S100A1P23297 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
S100A1P23297 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
S100A1P23297 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
S100A1P23297 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
S100A1P23297 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
S100A1P23297 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
S100A1P23297 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
S100A1P23297 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
S100A1P23297 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
S100A1P23297 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms