Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD33P20138 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD33P20138 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD33P20138 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD33P20138 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD33P20138 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD33P20138 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD33P20138 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD33P20138 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD33P20138 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD33P20138 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD33P20138 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD33P20138 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD33P20138 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD33P20138 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD33P20138 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD33P20138 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD33P20138 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD33P20138 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD33P20138 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD33P20138 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD33P20138 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD33P20138 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD33P20138 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD33P20138 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD33P20138 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD33P20138 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD33P20138 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CD33P20138 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD33P20138 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD33P20138 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD33P20138 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD33P20138 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD33P20138 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD33P20138 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD33P20138 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD33P20138 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD33P20138 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD33P20138 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD33P20138 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD33P20138 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD33P20138 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD33P20138 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD33P20138 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD33P20138 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD33P20138 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD33P20138 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD33P20138 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD33P20138 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD33P20138 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD33P20138 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD33P20138 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD33P20138 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD33P20138 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD33P20138 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD33P20138 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD33P20138 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD33P20138 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD33P20138 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD33P20138 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD33P20138 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD33P20138 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD33P20138 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD33P20138 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD33P20138 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD33P20138 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD33P20138 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD33P20138 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD33P20138 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD33P20138 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD33P20138 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD33P20138 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD33P20138 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD33P20138 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD33P20138 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD33P20138 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD33P20138 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD33P20138 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD33P20138 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD33P20138 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD33P20138 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD33P20138 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD33P20138 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD33P20138 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD33P20138 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD33P20138 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD33P20138 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD33P20138 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD33P20138 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD33P20138 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD33P20138 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD33P20138 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD33P20138 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD33P20138 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD33P20138 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD33P20138 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD33P20138 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD33P20138 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD33P20138 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD33P20138 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms