Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRA1P14867 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRA1P14867 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRA1P14867 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRA1P14867 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRA1P14867 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRA1P14867 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRA1P14867 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRA1P14867 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRA1P14867 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRA1P14867 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRA1P14867 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRA1P14867 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRA1P14867 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRA1P14867 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRA1P14867 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRA1P14867 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRA1P14867 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRA1P14867 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRA1P14867 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRA1P14867 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRA1P14867 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRA1P14867 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRA1P14867 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRA1P14867 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRA1P14867 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRA1P14867 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRA1P14867 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRA1P14867 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRA1P14867 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRA1P14867 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRA1P14867 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRA1P14867 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRA1P14867 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRA1P14867 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRA1P14867 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRA1P14867 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRA1P14867 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRA1P14867 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRA1P14867 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRA1P14867 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRA1P14867 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRA1P14867 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRA1P14867 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRA1P14867 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRA1P14867 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRA1P14867 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRA1P14867 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRA1P14867 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRA1P14867 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRA1P14867 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRA1P14867 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRA1P14867 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRA1P14867 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRA1P14867 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRA1P14867 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRA1P14867 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRA1P14867 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRA1P14867 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRA1P14867 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRA1P14867 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRA1P14867 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRA1P14867 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRA1P14867 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRA1P14867 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRA1P14867 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRA1P14867 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRA1P14867 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRA1P14867 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRA1P14867 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRA1P14867 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRA1P14867 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRA1P14867 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRA1P14867 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms