Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GABRA1P14867 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GABRA1P14867 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GABRA1P14867 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GABRA1P14867 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GABRA1P14867 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GABRA1P14867 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GABRA1P14867 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GABRA1P14867 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GABRA1P14867 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABRA1P14867 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GABRA1P14867 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GABRA1P14867 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GABRA1P14867 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GABRA1P14867 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GABRA1P14867 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GABRA1P14867 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GABRA1P14867 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GABRA1P14867 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GABRA1P14867 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABRA1P14867 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABRA1P14867 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABRA1P14867 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABRA1P14867 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GABRA1P14867 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GABRA1P14867 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRA1P14867 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GABRA1P14867 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABRA1P14867 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABRA1P14867 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABRA1P14867 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABRA1P14867 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABRA1P14867 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABRA1P14867 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABRA1P14867 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABRA1P14867 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GABRA1P14867 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GABRA1P14867 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GABRA1P14867 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRA1P14867 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRA1P14867 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABRA1P14867 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRA1P14867 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABRA1P14867 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GABRA1P14867 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABRA1P14867 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GABRA1P14867 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRA1P14867 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRA1P14867 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRA1P14867 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRA1P14867 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRA1P14867 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRA1P14867 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRA1P14867 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRA1P14867 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRA1P14867 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRA1P14867 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRA1P14867 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRA1P14867 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GABRA1P14867 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABRA1P14867 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRA1P14867 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRA1P14867 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRA1P14867 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABRA1P14867 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRA1P14867 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRA1P14867 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRA1P14867 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRA1P14867 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRA1P14867 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRA1P14867 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABRA1P14867 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GABRA1P14867 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRA1P14867 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRA1P14867 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GABRA1P14867 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRA1P14867 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRA1P14867 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABRA1P14867 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRA1P14867 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRA1P14867 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRA1P14867 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRA1P14867 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRA1P14867 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRA1P14867 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRA1P14867 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABRA1P14867 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRA1P14867 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRA1P14867 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRA1P14867 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRA1P14867 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRA1P14867 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRA1P14867 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABRA1P14867 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABRA1P14867 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABRA1P14867 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABRA1P14867 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRA1P14867 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRA1P14867 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRA1P14867 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms