Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTBP11277 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTBP11277 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTBP11277 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTBP11277 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTBP11277 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTBP11277 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTBP11277 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTBP11277 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTBP11277 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTBP11277 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTBP11277 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTBP11277 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTBP11277 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTBP11277 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPTBP11277 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPTBP11277 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPTBP11277 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTBP11277 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPTBP11277 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTBP11277 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTBP11277 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTBP11277 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPTBP11277 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTBP11277 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTBP11277 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTBP11277 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTBP11277 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTBP11277 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTBP11277 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTBP11277 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTBP11277 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPTBP11277 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBP11277 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBP11277 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTBP11277 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTBP11277 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTBP11277 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPTBP11277 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTBP11277 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBP11277 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBP11277 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBP11277 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTBP11277 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTBP11277 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTBP11277 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBP11277 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBP11277 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTBP11277 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTBP11277 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTBP11277 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTBP11277 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTBP11277 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPTBP11277 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTBP11277 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTBP11277 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTBP11277 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTBP11277 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTBP11277 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTBP11277 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTBP11277 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTBP11277 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTBP11277 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTBP11277 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTBP11277 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SPTBP11277 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTBP11277 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTBP11277 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTBP11277 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBP11277 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBP11277 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTBP11277 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTBP11277 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTBP11277 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTBP11277 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTBP11277 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBP11277 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBP11277 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBP11277 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBP11277 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBP11277 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTBP11277 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTBP11277 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTBP11277 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTBP11277 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTBP11277 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTBP11277 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTBP11277 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTBP11277 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTBP11277 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTBP11277 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTBP11277 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTBP11277 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTBP11277 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTBP11277 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTBP11277 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTBP11277 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTBP11277 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTBP11277 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTBP11277 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms