Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TPM2P07951 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TPM2P07951 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TPM2P07951 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TPM2P07951 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TPM2P07951 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TPM2P07951 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TPM2P07951 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TPM2P07951 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TPM2P07951 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TPM2P07951 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TPM2P07951 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TPM2P07951 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TPM2P07951 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TPM2P07951 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TPM2P07951 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TPM2P07951 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TPM2P07951 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TPM2P07951 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TPM2P07951 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TPM2P07951 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TPM2P07951 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TPM2P07951 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TPM2P07951 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TPM2P07951 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TPM2P07951 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TPM2P07951 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TPM2P07951 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TPM2P07951 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TPM2P07951 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TPM2P07951 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TPM2P07951 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TPM2P07951 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TPM2P07951 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TPM2P07951 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TPM2P07951 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TPM2P07951 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TPM2P07951 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TPM2P07951 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TPM2P07951 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TPM2P07951 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TPM2P07951 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TPM2P07951 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPM2P07951 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPM2P07951 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TPM2P07951 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TPM2P07951 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TPM2P07951 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TPM2P07951 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TPM2P07951 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TPM2P07951 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPM2P07951 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPM2P07951 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPM2P07951 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPM2P07951 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPM2P07951 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPM2P07951 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPM2P07951 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPM2P07951 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TPM2P07951 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TPM2P07951 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TPM2P07951 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TPM2P07951 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TPM2P07951 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TPM2P07951 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TPM2P07951 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPM2P07951 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPM2P07951 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPM2P07951 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TPM2P07951 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TPM2P07951 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TPM2P07951 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TPM2P07951 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TPM2P07951 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPM2P07951 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPM2P07951 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TPM2P07951 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPM2P07951 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPM2P07951 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPM2P07951 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TPM2P07951 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TPM2P07951 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TPM2P07951 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPM2P07951 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TPM2P07951 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TPM2P07951 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TPM2P07951 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TPM2P07951 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TPM2P07951 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TPM2P07951 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TPM2P07951 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TPM2P07951 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TPM2P07951 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TPM2P07951 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TPM2P07951 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TPM2P07951 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TPM2P07951 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TPM2P07951 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TPM2P07951 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TPM2P07951 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms