Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHEP01854 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHEP01854 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHEP01854 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGHEP01854 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHEP01854 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHEP01854 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGHEP01854 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHEP01854 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGHEP01854 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHEP01854 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHEP01854 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHEP01854 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHEP01854 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHEP01854 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHEP01854 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHEP01854 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGHEP01854 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IGHEP01854 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGHEP01854 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGHEP01854 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGHEP01854 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGHEP01854 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGHEP01854 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGHEP01854 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGHEP01854 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGHEP01854 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHEP01854 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHEP01854 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGHEP01854 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHEP01854 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHEP01854 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHEP01854 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHEP01854 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHEP01854 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHEP01854 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHEP01854 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHEP01854 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHEP01854 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGHEP01854 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHEP01854 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IGHEP01854 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGHEP01854 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGHEP01854 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGHEP01854 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGHEP01854 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGHEP01854 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGHEP01854 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGHEP01854 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGHEP01854 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGHEP01854 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGHEP01854 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGHEP01854 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGHEP01854 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGHEP01854 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGHEP01854 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGHEP01854 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGHEP01854 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGHEP01854 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGHEP01854 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGHEP01854 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGHEP01854 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGHEP01854 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHEP01854 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGHEP01854 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHEP01854 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHEP01854 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGHEP01854 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHEP01854 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHEP01854 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHEP01854 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHEP01854 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHEP01854 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHEP01854 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGHEP01854 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGHEP01854 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHEP01854 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHEP01854 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGHEP01854 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGHEP01854 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGHEP01854 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGHEP01854 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGHEP01854 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGHEP01854 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGHEP01854 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGHEP01854 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGHEP01854 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IGHEP01854 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGHEP01854 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGHEP01854 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGHEP01854 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGHEP01854 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGHEP01854 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGHEP01854 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGHEP01854 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGHEP01854 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGHEP01854 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGHEP01854 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGHEP01854 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGHEP01854 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms