Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATE1O95260 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATE1O95260 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATE1O95260 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATE1O95260 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATE1O95260 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATE1O95260 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATE1O95260 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATE1O95260 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATE1O95260 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATE1O95260 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATE1O95260 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATE1O95260 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATE1O95260 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATE1O95260 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATE1O95260 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATE1O95260 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATE1O95260 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATE1O95260 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATE1O95260 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATE1O95260 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATE1O95260 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATE1O95260 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATE1O95260 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATE1O95260 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATE1O95260 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATE1O95260 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATE1O95260 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATE1O95260 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATE1O95260 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATE1O95260 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATE1O95260 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATE1O95260 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATE1O95260 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATE1O95260 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATE1O95260 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATE1O95260 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATE1O95260 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATE1O95260 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATE1O95260 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATE1O95260 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATE1O95260 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATE1O95260 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATE1O95260 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATE1O95260 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATE1O95260 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATE1O95260 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATE1O95260 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATE1O95260 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATE1O95260 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATE1O95260 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATE1O95260 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATE1O95260 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATE1O95260 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATE1O95260 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATE1O95260 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATE1O95260 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATE1O95260 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATE1O95260 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATE1O95260 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATE1O95260 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATE1O95260 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATE1O95260 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATE1O95260 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATE1O95260 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATE1O95260 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATE1O95260 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATE1O95260 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATE1O95260 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATE1O95260 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATE1O95260 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATE1O95260 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATE1O95260 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATE1O95260 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATE1O95260 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATE1O95260 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATE1O95260 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATE1O95260 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATE1O95260 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATE1O95260 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATE1O95260 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATE1O95260 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATE1O95260 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATE1O95260 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATE1O95260 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATE1O95260 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATE1O95260 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATE1O95260 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATE1O95260 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATE1O95260 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATE1O95260 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATE1O95260 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATE1O95260 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATE1O95260 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATE1O95260 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATE1O95260 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATE1O95260 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATE1O95260 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATE1O95260 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATE1O95260 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms