Protein–RNA interactions for Protein: O95238

SPDEF, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDEFO95238 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDEFO95238 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDEFO95238 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDEFO95238 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDEFO95238 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDEFO95238 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDEFO95238 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDEFO95238 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDEFO95238 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDEFO95238 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDEFO95238 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPDEFO95238 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDEFO95238 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDEFO95238 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDEFO95238 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDEFO95238 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDEFO95238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDEFO95238 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDEFO95238 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDEFO95238 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDEFO95238 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDEFO95238 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPDEFO95238 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPDEFO95238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPDEFO95238 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPDEFO95238 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPDEFO95238 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPDEFO95238 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDEFO95238 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDEFO95238 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDEFO95238 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPDEFO95238 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPDEFO95238 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPDEFO95238 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPDEFO95238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPDEFO95238 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDEFO95238 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDEFO95238 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPDEFO95238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPDEFO95238 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPDEFO95238 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPDEFO95238 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPDEFO95238 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPDEFO95238 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPDEFO95238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDEFO95238 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDEFO95238 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPDEFO95238 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPDEFO95238 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPDEFO95238 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDEFO95238 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDEFO95238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPDEFO95238 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPDEFO95238 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDEFO95238 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPDEFO95238 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDEFO95238 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDEFO95238 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDEFO95238 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDEFO95238 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDEFO95238 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDEFO95238 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDEFO95238 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDEFO95238 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDEFO95238 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDEFO95238 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDEFO95238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDEFO95238 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDEFO95238 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDEFO95238 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDEFO95238 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPDEFO95238 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms