Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
TRPM2O94759 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TRPM2O94759 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TRPM2O94759 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
TRPM2O94759 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TRPM2O94759 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TRPM2O94759 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TRPM2O94759 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TRPM2O94759 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TRPM2O94759 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TRPM2O94759 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TRPM2O94759 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
TRPM2O94759 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
TRPM2O94759 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TRPM2O94759 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TRPM2O94759 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TRPM2O94759 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
TRPM2O94759 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
TRPM2O94759 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
TRPM2O94759 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TRPM2O94759 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TRPM2O94759 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TRPM2O94759 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TRPM2O94759 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
TRPM2O94759 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TRPM2O94759 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TRPM2O94759 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TRPM2O94759 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TRPM2O94759 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TRPM2O94759 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRPM2O94759 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRPM2O94759 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.02■■■■■ 4.32
TRPM2O94759 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
TRPM2O94759 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRPM2O94759 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
TRPM2O94759 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRPM2O94759 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRPM2O94759 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRPM2O94759 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
TRPM2O94759 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TRPM2O94759 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TRPM2O94759 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TRPM2O94759 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TRPM2O94759 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TRPM2O94759 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
TRPM2O94759 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TRPM2O94759 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TRPM2O94759 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
TRPM2O94759 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
TRPM2O94759 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TRPM2O94759 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
TRPM2O94759 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRPM2O94759 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
TRPM2O94759 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRPM2O94759 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRPM2O94759 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRPM2O94759 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TRPM2O94759 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TRPM2O94759 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
TRPM2O94759 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TRPM2O94759 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRPM2O94759 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRPM2O94759 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRPM2O94759 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
TRPM2O94759 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
TRPM2O94759 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TRPM2O94759 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TRPM2O94759 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
TRPM2O94759 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRPM2O94759 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TRPM2O94759 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
TRPM2O94759 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRPM2O94759 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TRPM2O94759 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRPM2O94759 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TRPM2O94759 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TRPM2O94759 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TRPM2O94759 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRPM2O94759 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TRPM2O94759 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TRPM2O94759 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TRPM2O94759 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TRPM2O94759 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TRPM2O94759 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TRPM2O94759 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TRPM2O94759 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TRPM2O94759 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TRPM2O94759 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
TRPM2O94759 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TRPM2O94759 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TRPM2O94759 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TRPM2O94759 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TRPM2O94759 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
TRPM2O94759 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TRPM2O94759 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TRPM2O94759 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRPM2O94759 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TRPM2O94759 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TRPM2O94759 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
TRPM2O94759 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms