Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSDE1O75534 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSDE1O75534 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSDE1O75534 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSDE1O75534 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CSDE1O75534 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CSDE1O75534 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CSDE1O75534 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CSDE1O75534 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CSDE1O75534 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CSDE1O75534 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CSDE1O75534 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CSDE1O75534 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CSDE1O75534 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CSDE1O75534 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CSDE1O75534 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSDE1O75534 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSDE1O75534 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CSDE1O75534 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CSDE1O75534 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CSDE1O75534 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CSDE1O75534 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CSDE1O75534 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CSDE1O75534 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CSDE1O75534 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CSDE1O75534 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CSDE1O75534 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CSDE1O75534 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CSDE1O75534 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CSDE1O75534 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CSDE1O75534 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CSDE1O75534 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CSDE1O75534 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CSDE1O75534 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CSDE1O75534 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CSDE1O75534 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CSDE1O75534 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CSDE1O75534 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CSDE1O75534 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CSDE1O75534 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CSDE1O75534 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CSDE1O75534 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CSDE1O75534 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CSDE1O75534 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CSDE1O75534 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CSDE1O75534 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CSDE1O75534 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CSDE1O75534 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CSDE1O75534 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CSDE1O75534 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CSDE1O75534 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CSDE1O75534 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CSDE1O75534 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CSDE1O75534 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CSDE1O75534 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CSDE1O75534 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CSDE1O75534 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CSDE1O75534 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CSDE1O75534 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CSDE1O75534 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CSDE1O75534 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSDE1O75534 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSDE1O75534 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CSDE1O75534 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CSDE1O75534 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CSDE1O75534 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CSDE1O75534 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSDE1O75534 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CSDE1O75534 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CSDE1O75534 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CSDE1O75534 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CSDE1O75534 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CSDE1O75534 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CSDE1O75534 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CSDE1O75534 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CSDE1O75534 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CSDE1O75534 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CSDE1O75534 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CSDE1O75534 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CSDE1O75534 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CSDE1O75534 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CSDE1O75534 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CSDE1O75534 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CSDE1O75534 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSDE1O75534 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CSDE1O75534 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CSDE1O75534 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CSDE1O75534 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CSDE1O75534 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CSDE1O75534 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CSDE1O75534 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms