Protein–RNA interactions for Protein: O60678

PRMT3, Protein arginine N-methyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT3O60678 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRMT3O60678 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PRMT3O60678 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRMT3O60678 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRMT3O60678 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRMT3O60678 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRMT3O60678 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRMT3O60678 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRMT3O60678 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRMT3O60678 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRMT3O60678 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRMT3O60678 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRMT3O60678 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRMT3O60678 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRMT3O60678 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRMT3O60678 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRMT3O60678 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRMT3O60678 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRMT3O60678 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRMT3O60678 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRMT3O60678 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRMT3O60678 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRMT3O60678 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRMT3O60678 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRMT3O60678 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRMT3O60678 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRMT3O60678 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRMT3O60678 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRMT3O60678 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRMT3O60678 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRMT3O60678 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRMT3O60678 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRMT3O60678 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRMT3O60678 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRMT3O60678 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRMT3O60678 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRMT3O60678 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRMT3O60678 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRMT3O60678 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRMT3O60678 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRMT3O60678 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRMT3O60678 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRMT3O60678 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRMT3O60678 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRMT3O60678 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRMT3O60678 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRMT3O60678 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRMT3O60678 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRMT3O60678 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRMT3O60678 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRMT3O60678 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRMT3O60678 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRMT3O60678 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRMT3O60678 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRMT3O60678 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRMT3O60678 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRMT3O60678 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms