Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYNCRIPO60506 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNCRIPO60506 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYNCRIPO60506 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYNCRIPO60506 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYNCRIPO60506 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYNCRIPO60506 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNCRIPO60506 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYNCRIPO60506 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNCRIPO60506 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNCRIPO60506 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYNCRIPO60506 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNCRIPO60506 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNCRIPO60506 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNCRIPO60506 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNCRIPO60506 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNCRIPO60506 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNCRIPO60506 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNCRIPO60506 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNCRIPO60506 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNCRIPO60506 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNCRIPO60506 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNCRIPO60506 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNCRIPO60506 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNCRIPO60506 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNCRIPO60506 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNCRIPO60506 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNCRIPO60506 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNCRIPO60506 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNCRIPO60506 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNCRIPO60506 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNCRIPO60506 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNCRIPO60506 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNCRIPO60506 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNCRIPO60506 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNCRIPO60506 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNCRIPO60506 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNCRIPO60506 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNCRIPO60506 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNCRIPO60506 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNCRIPO60506 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNCRIPO60506 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNCRIPO60506 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNCRIPO60506 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNCRIPO60506 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNCRIPO60506 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNCRIPO60506 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNCRIPO60506 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNCRIPO60506 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNCRIPO60506 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNCRIPO60506 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNCRIPO60506 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNCRIPO60506 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNCRIPO60506 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNCRIPO60506 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNCRIPO60506 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNCRIPO60506 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNCRIPO60506 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNCRIPO60506 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNCRIPO60506 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNCRIPO60506 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNCRIPO60506 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNCRIPO60506 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNCRIPO60506 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNCRIPO60506 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNCRIPO60506 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNCRIPO60506 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNCRIPO60506 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNCRIPO60506 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNCRIPO60506 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNCRIPO60506 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNCRIPO60506 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNCRIPO60506 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNCRIPO60506 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNCRIPO60506 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNCRIPO60506 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNCRIPO60506 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNCRIPO60506 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNCRIPO60506 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNCRIPO60506 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNCRIPO60506 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNCRIPO60506 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNCRIPO60506 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNCRIPO60506 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNCRIPO60506 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNCRIPO60506 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNCRIPO60506 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNCRIPO60506 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNCRIPO60506 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNCRIPO60506 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms