Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUV39H1O43463 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUV39H1O43463 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUV39H1O43463 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUV39H1O43463 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUV39H1O43463 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUV39H1O43463 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUV39H1O43463 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUV39H1O43463 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUV39H1O43463 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUV39H1O43463 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUV39H1O43463 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SUV39H1O43463 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUV39H1O43463 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUV39H1O43463 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUV39H1O43463 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUV39H1O43463 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUV39H1O43463 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUV39H1O43463 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUV39H1O43463 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUV39H1O43463 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUV39H1O43463 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUV39H1O43463 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms