Protein–RNA interactions for Protein: O15266

SHOX, Short stature homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOXO15266 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHOXO15266 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHOXO15266 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHOXO15266 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHOXO15266 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHOXO15266 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHOXO15266 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHOXO15266 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHOXO15266 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHOXO15266 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHOXO15266 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHOXO15266 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHOXO15266 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHOXO15266 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHOXO15266 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHOXO15266 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOXO15266 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOXO15266 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHOXO15266 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOXO15266 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOXO15266 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHOXO15266 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOXO15266 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOXO15266 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOXO15266 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHOXO15266 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHOXO15266 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHOXO15266 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHOXO15266 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHOXO15266 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOXO15266 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOXO15266 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOXO15266 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOXO15266 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOXO15266 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOXO15266 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHOXO15266 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHOXO15266 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHOXO15266 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHOXO15266 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHOXO15266 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOXO15266 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOXO15266 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHOXO15266 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHOXO15266 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHOXO15266 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHOXO15266 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHOXO15266 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOXO15266 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHOXO15266 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOXO15266 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHOXO15266 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOXO15266 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHOXO15266 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHOXO15266 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOXO15266 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHOXO15266 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHOXO15266 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOXO15266 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOXO15266 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHOXO15266 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHOXO15266 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHOXO15266 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHOXO15266 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOXO15266 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOXO15266 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHOXO15266 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHOXO15266 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHOXO15266 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHOXO15266 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHOXO15266 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHOXO15266 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOXO15266 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOXO15266 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHOXO15266 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOXO15266 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOXO15266 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHOXO15266 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOXO15266 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHOXO15266 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOXO15266 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHOXO15266 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHOXO15266 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHOXO15266 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOXO15266 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOXO15266 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHOXO15266 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHOXO15266 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHOXO15266 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHOXO15266 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHOXO15266 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHOXO15266 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOXO15266 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOXO15266 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHOXO15266 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHOXO15266 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOXO15266 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHOXO15266 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHOXO15266 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHOXO15266 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms