Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
APAF1O14727 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
APAF1O14727 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
APAF1O14727 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
APAF1O14727 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
APAF1O14727 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
APAF1O14727 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
APAF1O14727 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
APAF1O14727 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
APAF1O14727 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
APAF1O14727 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
APAF1O14727 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
APAF1O14727 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
APAF1O14727 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
APAF1O14727 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
APAF1O14727 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
APAF1O14727 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
APAF1O14727 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
APAF1O14727 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
APAF1O14727 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
APAF1O14727 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
APAF1O14727 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
APAF1O14727 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
APAF1O14727 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
APAF1O14727 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
APAF1O14727 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
APAF1O14727 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
APAF1O14727 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
APAF1O14727 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
APAF1O14727 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
APAF1O14727 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
APAF1O14727 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
APAF1O14727 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
APAF1O14727 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
APAF1O14727 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
APAF1O14727 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
APAF1O14727 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
APAF1O14727 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
APAF1O14727 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
APAF1O14727 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
APAF1O14727 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
APAF1O14727 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
APAF1O14727 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
APAF1O14727 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
APAF1O14727 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
APAF1O14727 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
APAF1O14727 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
APAF1O14727 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
APAF1O14727 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
APAF1O14727 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
APAF1O14727 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
APAF1O14727 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
APAF1O14727 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
APAF1O14727 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
APAF1O14727 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
APAF1O14727 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
APAF1O14727 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
APAF1O14727 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
APAF1O14727 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
APAF1O14727 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
APAF1O14727 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
APAF1O14727 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
APAF1O14727 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
APAF1O14727 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
APAF1O14727 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
APAF1O14727 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
APAF1O14727 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
APAF1O14727 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
APAF1O14727 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
APAF1O14727 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
APAF1O14727 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
APAF1O14727 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
APAF1O14727 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
APAF1O14727 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
APAF1O14727 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
APAF1O14727 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
APAF1O14727 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
APAF1O14727 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
APAF1O14727 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
APAF1O14727 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
APAF1O14727 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
APAF1O14727 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
APAF1O14727 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
APAF1O14727 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
APAF1O14727 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
APAF1O14727 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
APAF1O14727 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
APAF1O14727 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
APAF1O14727 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
APAF1O14727 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
APAF1O14727 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
APAF1O14727 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
APAF1O14727 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
APAF1O14727 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
APAF1O14727 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
APAF1O14727 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
APAF1O14727 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
APAF1O14727 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
APAF1O14727 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
APAF1O14727 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms