Protein–RNA interactions for Protein: O00422

SAP18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP18O00422 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAP18O00422 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SAP18O00422 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SAP18O00422 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SAP18O00422 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAP18O00422 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAP18O00422 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAP18O00422 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAP18O00422 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAP18O00422 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAP18O00422 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAP18O00422 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAP18O00422 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAP18O00422 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAP18O00422 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAP18O00422 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAP18O00422 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAP18O00422 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAP18O00422 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAP18O00422 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAP18O00422 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAP18O00422 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAP18O00422 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAP18O00422 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAP18O00422 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAP18O00422 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAP18O00422 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAP18O00422 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAP18O00422 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAP18O00422 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SAP18O00422 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAP18O00422 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAP18O00422 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAP18O00422 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAP18O00422 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAP18O00422 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAP18O00422 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAP18O00422 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAP18O00422 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAP18O00422 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAP18O00422 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAP18O00422 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAP18O00422 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAP18O00422 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAP18O00422 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SAP18O00422 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SAP18O00422 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SAP18O00422 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SAP18O00422 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SAP18O00422 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SAP18O00422 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SAP18O00422 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAP18O00422 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAP18O00422 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAP18O00422 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SAP18O00422 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SAP18O00422 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAP18O00422 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SAP18O00422 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SAP18O00422 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAP18O00422 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SAP18O00422 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAP18O00422 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAP18O00422 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SAP18O00422 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAP18O00422 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SAP18O00422 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAP18O00422 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAP18O00422 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAP18O00422 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAP18O00422 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAP18O00422 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAP18O00422 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAP18O00422 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAP18O00422 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAP18O00422 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAP18O00422 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SAP18O00422 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAP18O00422 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAP18O00422 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAP18O00422 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAP18O00422 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SAP18O00422 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAP18O00422 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAP18O00422 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAP18O00422 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAP18O00422 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAP18O00422 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAP18O00422 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAP18O00422 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAP18O00422 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAP18O00422 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAP18O00422 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAP18O00422 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SAP18O00422 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAP18O00422 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAP18O00422 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAP18O00422 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAP18O00422 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAP18O00422 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms