Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP2O00295 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TULP2O00295 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TULP2O00295 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TULP2O00295 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TULP2O00295 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TULP2O00295 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TULP2O00295 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TULP2O00295 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TULP2O00295 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TULP2O00295 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TULP2O00295 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TULP2O00295 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TULP2O00295 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TULP2O00295 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TULP2O00295 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TULP2O00295 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TULP2O00295 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TULP2O00295 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TULP2O00295 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TULP2O00295 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TULP2O00295 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TULP2O00295 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TULP2O00295 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TULP2O00295 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TULP2O00295 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TULP2O00295 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TULP2O00295 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TULP2O00295 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TULP2O00295 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TULP2O00295 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TULP2O00295 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TULP2O00295 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TULP2O00295 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TULP2O00295 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TULP2O00295 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TULP2O00295 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TULP2O00295 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TULP2O00295 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TULP2O00295 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TULP2O00295 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TULP2O00295 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TULP2O00295 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TULP2O00295 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TULP2O00295 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TULP2O00295 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TULP2O00295 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TULP2O00295 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TULP2O00295 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TULP2O00295 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TULP2O00295 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TULP2O00295 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TULP2O00295 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TULP2O00295 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TULP2O00295 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TULP2O00295 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TULP2O00295 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TULP2O00295 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TULP2O00295 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TULP2O00295 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TULP2O00295 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TULP2O00295 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TULP2O00295 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP2O00295 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP2O00295 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TULP2O00295 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP2O00295 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TULP2O00295 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TULP2O00295 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TULP2O00295 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TULP2O00295 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TULP2O00295 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP2O00295 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TULP2O00295 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TULP2O00295 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TULP2O00295 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TULP2O00295 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TULP2O00295 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TULP2O00295 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TULP2O00295 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TULP2O00295 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TULP2O00295 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TULP2O00295 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TULP2O00295 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TULP2O00295 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TULP2O00295 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TULP2O00295 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TULP2O00295 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP2O00295 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TULP2O00295 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TULP2O00295 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TULP2O00295 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TULP2O00295 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TULP2O00295 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TULP2O00295 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP2O00295 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP2O00295 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP2O00295 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP2O00295 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP2O00295 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms