Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBY3A6NI87 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBY3A6NI87 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CBY3A6NI87 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBY3A6NI87 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBY3A6NI87 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBY3A6NI87 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBY3A6NI87 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBY3A6NI87 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBY3A6NI87 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBY3A6NI87 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBY3A6NI87 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBY3A6NI87 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBY3A6NI87 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBY3A6NI87 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBY3A6NI87 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBY3A6NI87 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBY3A6NI87 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBY3A6NI87 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CBY3A6NI87 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBY3A6NI87 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBY3A6NI87 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CBY3A6NI87 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBY3A6NI87 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBY3A6NI87 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBY3A6NI87 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBY3A6NI87 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBY3A6NI87 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBY3A6NI87 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CBY3A6NI87 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBY3A6NI87 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBY3A6NI87 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBY3A6NI87 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBY3A6NI87 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBY3A6NI87 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBY3A6NI87 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBY3A6NI87 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CBY3A6NI87 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CBY3A6NI87 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CBY3A6NI87 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CBY3A6NI87 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CBY3A6NI87 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CBY3A6NI87 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CBY3A6NI87 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CBY3A6NI87 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CBY3A6NI87 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBY3A6NI87 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBY3A6NI87 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBY3A6NI87 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBY3A6NI87 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBY3A6NI87 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBY3A6NI87 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBY3A6NI87 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBY3A6NI87 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBY3A6NI87 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBY3A6NI87 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBY3A6NI87 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CBY3A6NI87 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBY3A6NI87 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBY3A6NI87 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CBY3A6NI87 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBY3A6NI87 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CBY3A6NI87 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBY3A6NI87 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBY3A6NI87 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CBY3A6NI87 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBY3A6NI87 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CBY3A6NI87 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBY3A6NI87 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBY3A6NI87 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CBY3A6NI87 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBY3A6NI87 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBY3A6NI87 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBY3A6NI87 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBY3A6NI87 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBY3A6NI87 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBY3A6NI87 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms