Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT87PA6NCN2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT87PA6NCN2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT87PA6NCN2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT87PA6NCN2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT87PA6NCN2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT87PA6NCN2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT87PA6NCN2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT87PA6NCN2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT87PA6NCN2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT87PA6NCN2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT87PA6NCN2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT87PA6NCN2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT87PA6NCN2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT87PA6NCN2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT87PA6NCN2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT87PA6NCN2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT87PA6NCN2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT87PA6NCN2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT87PA6NCN2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT87PA6NCN2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT87PA6NCN2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT87PA6NCN2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT87PA6NCN2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT87PA6NCN2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT87PA6NCN2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT87PA6NCN2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT87PA6NCN2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT87PA6NCN2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT87PA6NCN2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT87PA6NCN2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT87PA6NCN2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT87PA6NCN2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT87PA6NCN2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT87PA6NCN2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT87PA6NCN2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT87PA6NCN2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT87PA6NCN2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT87PA6NCN2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT87PA6NCN2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT87PA6NCN2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT87PA6NCN2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
KRT87PA6NCN2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT87PA6NCN2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT87PA6NCN2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT87PA6NCN2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT87PA6NCN2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT87PA6NCN2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT87PA6NCN2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT87PA6NCN2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT87PA6NCN2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT87PA6NCN2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT87PA6NCN2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT87PA6NCN2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT87PA6NCN2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT87PA6NCN2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT87PA6NCN2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT87PA6NCN2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT87PA6NCN2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT87PA6NCN2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT87PA6NCN2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT87PA6NCN2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT87PA6NCN2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT87PA6NCN2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT87PA6NCN2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT87PA6NCN2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT87PA6NCN2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms