Protein–RNA interactions for Protein: A6NC97

FAM172BP, Putative protein FAM172B, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM172BPA6NC97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM172BPA6NC97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM172BPA6NC97 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM172BPA6NC97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM172BPA6NC97 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM172BPA6NC97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM172BPA6NC97 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM172BPA6NC97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM172BPA6NC97 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM172BPA6NC97 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM172BPA6NC97 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM172BPA6NC97 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM172BPA6NC97 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM172BPA6NC97 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM172BPA6NC97 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM172BPA6NC97 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172BPA6NC97 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172BPA6NC97 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172BPA6NC97 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM172BPA6NC97 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM172BPA6NC97 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM172BPA6NC97 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM172BPA6NC97 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM172BPA6NC97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM172BPA6NC97 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM172BPA6NC97 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM172BPA6NC97 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM172BPA6NC97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM172BPA6NC97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM172BPA6NC97 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM172BPA6NC97 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM172BPA6NC97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM172BPA6NC97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM172BPA6NC97 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM172BPA6NC97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM172BPA6NC97 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM172BPA6NC97 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM172BPA6NC97 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM172BPA6NC97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM172BPA6NC97 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM172BPA6NC97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM172BPA6NC97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM172BPA6NC97 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM172BPA6NC97 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM172BPA6NC97 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM172BPA6NC97 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM172BPA6NC97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM172BPA6NC97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM172BPA6NC97 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM172BPA6NC97 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM172BPA6NC97 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms