Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP5LA4QPB2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP5LA4QPB2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP5LA4QPB2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP5LA4QPB2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP5LA4QPB2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP5LA4QPB2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP5LA4QPB2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP5LA4QPB2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP5LA4QPB2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP5LA4QPB2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP5LA4QPB2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP5LA4QPB2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP5LA4QPB2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP5LA4QPB2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5LA4QPB2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5LA4QPB2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5LA4QPB2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5LA4QPB2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5LA4QPB2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRP5LA4QPB2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP5LA4QPB2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRP5LA4QPB2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRP5LA4QPB2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRP5LA4QPB2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRP5LA4QPB2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRP5LA4QPB2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRP5LA4QPB2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRP5LA4QPB2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP5LA4QPB2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRP5LA4QPB2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRP5LA4QPB2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRP5LA4QPB2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP5LA4QPB2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRP5LA4QPB2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRP5LA4QPB2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP5LA4QPB2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5LA4QPB2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5LA4QPB2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5LA4QPB2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5LA4QPB2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5LA4QPB2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5LA4QPB2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5LA4QPB2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5LA4QPB2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5LA4QPB2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5LA4QPB2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRP5LA4QPB2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP5LA4QPB2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP5LA4QPB2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP5LA4QPB2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRP5LA4QPB2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP5LA4QPB2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP5LA4QPB2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP5LA4QPB2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP5LA4QPB2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRP5LA4QPB2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRP5LA4QPB2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRP5LA4QPB2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP5LA4QPB2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRP5LA4QPB2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRP5LA4QPB2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRP5LA4QPB2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP5LA4QPB2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRP5LA4QPB2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRP5LA4QPB2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP5LA4QPB2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP5LA4QPB2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRP5LA4QPB2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRP5LA4QPB2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms