Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQK1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQK1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQK1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQK1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQK1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQK1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQK1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQK1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RQK1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RQK1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RQK1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RQK1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0U1RQK1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0U1RQK1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQK1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0U1RQK1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQK1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQK1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQK1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQK1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQK1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RQK1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RQK1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQK1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQK1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQK1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0U1RQK1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQK1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQK1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQK1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQK1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQK1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQK1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQK1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQK1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RQK1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQK1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQK1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQK1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQK1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQK1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQK1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQK1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQK1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms