Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1Y9

IGHV3-72, Immunoglobulin heavy variable 3-72, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms