Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTR3BQ9P1U1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3BQ9P1U1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms