Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNPLA3Q9NST1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNPLA3Q9NST1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms