Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ROPN1BQ9BZX4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms