Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NEURL4Q96JN8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NEURL4Q96JN8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NEURL4Q96JN8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NEURL4Q96JN8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms