RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570631.5

PSKH1-202, Transcript of protein serine kinase H1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSKH1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSKH1-202ENST00000570631 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.52■■■■■ 6.48
PSKH1-202ENST00000570631 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.62■■■■■ 5.53
PSKH1-202ENST00000570631 ABCC9O60706 1549 aa49.26■■■■■ 5.48
PSKH1-202ENST00000570631 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.03■■■■■ 5.12
PSKH1-202ENST00000570631 NACADO15069 1562 aa46.79■■■■■ 5.08
PSKH1-202ENST00000570631 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.77■■■■■ 5.08
PSKH1-202ENST00000570631 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.23■■■■■ 4.99
PSKH1-202ENST00000570631 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
PSKH1-202ENST00000570631 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.04■■■■■ 4.96
PSKH1-202ENST00000570631 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.93■■■■■ 4.94
PSKH1-202ENST00000570631 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.83■■■■■ 4.93
PSKH1-202ENST00000570631 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.76■■■■■ 4.92
PSKH1-202ENST00000570631 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.64■■■■■ 4.9
PSKH1-202ENST00000570631 SCRIBQ14160 1630 aa45.34■■■■■ 4.85
PSKH1-202ENST00000570631 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45■■■■■ 4.79
PSKH1-202ENST00000570631 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.5■■■■■ 4.71
PSKH1-202ENST00000570631 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
PSKH1-202ENST00000570631 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.29■■■■■ 4.68
PSKH1-202ENST00000570631 SMARCA4P51532 1647 aa43.24■■■■■ 4.51
PSKH1-202ENST00000570631 NCAPD3P42695 1498 aa43.17■■■■■ 4.5
PSKH1-202ENST00000570631 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.15■■■■■ 4.5
PSKH1-202ENST00000570631 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
PSKH1-202ENST00000570631 SMARCA2P51531 1590 aa43.05■■■■■ 4.48
PSKH1-202ENST00000570631 HMGXB3Q12766 1538 aa42.92■■■■■ 4.46
PSKH1-202ENST00000570631 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.82■■■■■ 4.45
PSKH1-202ENST00000570631 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
PSKH1-202ENST00000570631 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.75■■■■■ 4.43
PSKH1-202ENST00000570631 ERCC6Q03468 1493 aa42.5■■■■■ 4.39
PSKH1-202ENST00000570631 NESP48681 1621 aa42.44■■■■■ 4.38
PSKH1-202ENST00000570631 WIZO95785 1651 aa42.36■■■■■ 4.37
PSKH1-202ENST00000570631 CUX2O14529 1486 aa42.18■■■■■ 4.34
PSKH1-202ENST00000570631 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.16■■■■■ 4.34
PSKH1-202ENST00000570631 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
PSKH1-202ENST00000570631 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.93■■■■■ 4.3
PSKH1-202ENST00000570631 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.9■■■■■ 4.3
PSKH1-202ENST00000570631 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.9■■■■■ 4.3
PSKH1-202ENST00000570631 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
PSKH1-202ENST00000570631 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
PSKH1-202ENST00000570631 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.64■■■■■ 4.26
PSKH1-202ENST00000570631 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.53■■■■■ 4.24
PSKH1-202ENST00000570631 CFTRP13569 1480 aa41.52■■■■■ 4.24
PSKH1-202ENST00000570631 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.48■■■■■ 4.23
PSKH1-202ENST00000570631 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.47■■■■■ 4.23
PSKH1-202ENST00000570631 WDR62O43379 1518 aa41.4■■■■■ 4.22
PSKH1-202ENST00000570631 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.34■■■■■ 4.21
PSKH1-202ENST00000570631 PRDM2Q13029 1718 aa41.22■■■■■ 4.19
PSKH1-202ENST00000570631 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
PSKH1-202ENST00000570631 TOPBP1Q92547 1522 aa40.73■■■■■ 4.11
PSKH1-202ENST00000570631 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
PSKH1-202ENST00000570631 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.62■■■■■ 4.09
PSKH1-202ENST00000570631 ABCC8Q09428 1581 aa40.62■■■■■ 4.09
PSKH1-202ENST00000570631 IFT140Q96RY7 1462 aa40.59■■■■■ 4.09
PSKH1-202ENST00000570631 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
PSKH1-202ENST00000570631 OSCARQ8IYS5 282 aa40.35■■■■■ 4.05
PSKH1-202ENST00000570631 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
PSKH1-202ENST00000570631 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
PSKH1-202ENST00000570631 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
PSKH1-202ENST00000570631 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
PSKH1-202ENST00000570631 CUX1P39880 1505 aa40.21■■■■■ 4.03
PSKH1-202ENST00000570631 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.21■■■■■ 4.03
PSKH1-202ENST00000570631 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.17■■■■■ 4.02
PSKH1-202ENST00000570631 SOGA1O94964 1423 aa40.16■■■■■ 4.02
PSKH1-202ENST00000570631 TRIM41Q8WV44 630 aa40.13■■■■■ 4.01
PSKH1-202ENST00000570631 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
PSKH1-202ENST00000570631 CHD1O14646 1710 aa39.99■■■■□ 3.99
PSKH1-202ENST00000570631 FBLN2P98095 1184 aa39.92■■■■□ 3.98
PSKH1-202ENST00000570631 WDR97A6NE52 1622 aa39.9■■■■□ 3.98
PSKH1-202ENST00000570631 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.84■■■■□ 3.97
PSKH1-202ENST00000570631 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
PSKH1-202ENST00000570631 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
PSKH1-202ENST00000570631 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
PSKH1-202ENST00000570631 GRIN2BQ13224 1484 aa39.76■■■■□ 3.95
PSKH1-202ENST00000570631 ARHGEF11O15085 1522 aa39.74■■■■□ 3.95
PSKH1-202ENST00000570631 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
PSKH1-202ENST00000570631 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.7■■■■□ 3.95
PSKH1-202ENST00000570631 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.7■■■■□ 3.95
PSKH1-202ENST00000570631 PBRM1Q86U86 1689 aa39.69■■■■□ 3.94
PSKH1-202ENST00000570631 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.69■■■■□ 3.94
PSKH1-202ENST00000570631 SYNJ1O43426 1573 aa39.67■■■■□ 3.94
PSKH1-202ENST00000570631 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.67■■■■□ 3.94
PSKH1-202ENST00000570631 TOP2BQ02880 1626 aa39.67■■■■□ 3.94
PSKH1-202ENST00000570631 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
PSKH1-202ENST00000570631 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.63■■■■□ 3.94
PSKH1-202ENST00000570631 SYNJ2O15056 1496 aa39.58■■■■□ 3.93
PSKH1-202ENST00000570631 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.47■■■■□ 3.91
PSKH1-202ENST00000570631 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.44■■■■□ 3.9
PSKH1-202ENST00000570631 ARAP1Q96P48 1450 aa39.38■■■■□ 3.89
PSKH1-202ENST00000570631 ADAMTS12P58397 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
PSKH1-202ENST00000570631 GRIN2AQ12879 1464 aa39.26■■■■□ 3.87
PSKH1-202ENST00000570631 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.21■■■■□ 3.87
PSKH1-202ENST00000570631 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.18■■■■□ 3.86
PSKH1-202ENST00000570631 CEP170Q5SW79 1584 aa39.12■■■■□ 3.85
PSKH1-202ENST00000570631 NUP160Q12769 1436 aa39.08■■■■□ 3.85
PSKH1-202ENST00000570631 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.94■■■■□ 3.82
PSKH1-202ENST00000570631 KIF27Q86VH2 1401 aa38.9■■■■□ 3.82
PSKH1-202ENST00000570631 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
PSKH1-202ENST00000570631 SHROOM2Q13796 1616 aa38.87■■■■□ 3.81
PSKH1-202ENST00000570631 IGF1RP08069 1367 aa38.82■■■■□ 3.8
PSKH1-202ENST00000570631 CUL7Q14999 1698 aa38.76■■■■□ 3.8
PSKH1-202ENST00000570631 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.75■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms