Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.42■■■■■ 5.66
NEURL4Q96JN8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.03■■■■■ 5.6
NEURL4Q96JN8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.86■■■■■ 5.57
NEURL4Q96JN8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
NEURL4Q96JN8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
NEURL4Q96JN8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
NEURL4Q96JN8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
NEURL4Q96JN8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
NEURL4Q96JN8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
NEURL4Q96JN8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
NEURL4Q96JN8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NEURL4Q96JN8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.03■■■■■ 5.28
NEURL4Q96JN8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
NEURL4Q96JN8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.71■■■■■ 5.23
NEURL4Q96JN8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
NEURL4Q96JN8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
NEURL4Q96JN8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
NEURL4Q96JN8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
NEURL4Q96JN8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
NEURL4Q96JN8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
NEURL4Q96JN8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
NEURL4Q96JN8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
NEURL4Q96JN8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NEURL4Q96JN8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NEURL4Q96JN8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
NEURL4Q96JN8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
NEURL4Q96JN8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
NEURL4Q96JN8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.29■■■■■ 5
NEURL4Q96JN8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
NEURL4Q96JN8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.99
NEURL4Q96JN8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
NEURL4Q96JN8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
NEURL4Q96JN8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
NEURL4Q96JN8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
NEURL4Q96JN8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
NEURL4Q96JN8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
NEURL4Q96JN8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
NEURL4Q96JN8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
NEURL4Q96JN8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
NEURL4Q96JN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
NEURL4Q96JN8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
NEURL4Q96JN8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NEURL4Q96JN8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
NEURL4Q96JN8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
NEURL4Q96JN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
NEURL4Q96JN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NEURL4Q96JN8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
NEURL4Q96JN8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
NEURL4Q96JN8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
NEURL4Q96JN8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
NEURL4Q96JN8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NEURL4Q96JN8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
NEURL4Q96JN8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NEURL4Q96JN8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
NEURL4Q96JN8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
NEURL4Q96JN8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
NEURL4Q96JN8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
NEURL4Q96JN8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
NEURL4Q96JN8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.39■■■■■ 4.7
NEURL4Q96JN8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
NEURL4Q96JN8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
NEURL4Q96JN8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
NEURL4Q96JN8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
NEURL4Q96JN8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
NEURL4Q96JN8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NEURL4Q96JN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
NEURL4Q96JN8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NEURL4Q96JN8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NEURL4Q96JN8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
NEURL4Q96JN8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
NEURL4Q96JN8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
NEURL4Q96JN8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
NEURL4Q96JN8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
NEURL4Q96JN8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
NEURL4Q96JN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
NEURL4Q96JN8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
NEURL4Q96JN8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
NEURL4Q96JN8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NEURL4Q96JN8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
NEURL4Q96JN8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
NEURL4Q96JN8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
NEURL4Q96JN8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
NEURL4Q96JN8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
NEURL4Q96JN8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
NEURL4Q96JN8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
NEURL4Q96JN8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
NEURL4Q96JN8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
NEURL4Q96JN8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
NEURL4Q96JN8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
NEURL4Q96JN8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NEURL4Q96JN8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NEURL4Q96JN8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
NEURL4Q96JN8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.54
NEURL4Q96JN8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NEURL4Q96JN8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms