Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NMD3Q96D46 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMD3Q96D46 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms