Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C17orf53Q8N3J3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C17orf53Q8N3J3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms