RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375249.4

HABP4-201, Transcript of hyaluronan binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HABP4, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4-201ENST00000375249 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.89■■■■■ 4.14
HABP4-201ENST00000375249 HRCP23327 699 aa35.85■■■■□ 3.33
HABP4-201ENST00000375249 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.82■■■■□ 3.32
HABP4-201ENST00000375249 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
HABP4-201ENST00000375249 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.23■■■■□ 3.23
HABP4-201ENST00000375249 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.15■■■■□ 3.22
HABP4-201ENST00000375249 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.12■■■■□ 3.21
HABP4-201ENST00000375249 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
HABP4-201ENST00000375249 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
HABP4-201ENST00000375249 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.56■■■■□ 3.12
HABP4-201ENST00000375249 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
HABP4-201ENST00000375249 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.19■■■■□ 3.06
HABP4-201ENST00000375249 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
HABP4-201ENST00000375249 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.1■■■■□ 3.05
HABP4-201ENST00000375249 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
HABP4-201ENST00000375249 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.85■■■■□ 3.01
HABP4-201ENST00000375249 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
HABP4-201ENST00000375249 TRIM41Q8WV44 630 aa33.07■■■□□ 2.88
HABP4-201ENST00000375249 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
HABP4-201ENST00000375249 ABCC9O60706 1549 aa32.98■■■□□ 2.87
HABP4-201ENST00000375249 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
HABP4-201ENST00000375249 NEUROD1Q13562 356 aa32.9■■■□□ 2.86
HABP4-201ENST00000375249 MYT1Q01538 1121 aa32.89■■■□□ 2.86
HABP4-201ENST00000375249 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
HABP4-201ENST00000375249 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa32.68■■■□□ 2.82
HABP4-201ENST00000375249 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.66■■■□□ 2.82
HABP4-201ENST00000375249 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
HABP4-201ENST00000375249 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
HABP4-201ENST00000375249 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
HABP4-201ENST00000375249 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.6■■■□□ 2.81
HABP4-201ENST00000375249 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
HABP4-201ENST00000375249 SCRIBQ14160 1630 aa32.32■■■□□ 2.76
HABP4-201ENST00000375249 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
HABP4-201ENST00000375249 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.98■■■□□ 2.71
HABP4-201ENST00000375249 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.93■■■□□ 2.7
HABP4-201ENST00000375249 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.89■■■□□ 2.7
HABP4-201ENST00000375249 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
HABP4-201ENST00000375249 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
HABP4-201ENST00000375249 CEP162Q5TB80 1403 aa31.75■■■□□ 2.67
HABP4-201ENST00000375249 MIER1Q8N108 512 aa31.74■■■□□ 2.67
HABP4-201ENST00000375249 WIZO95785 1651 aa31.74■■■□□ 2.67
HABP4-201ENST00000375249 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
HABP4-201ENST00000375249 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.62■■■□□ 2.65
HABP4-201ENST00000375249 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
HABP4-201ENST00000375249 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.55■■■□□ 2.64
HABP4-201ENST00000375249 ABCC8Q09428 1581 aa31.46■■■□□ 2.63
HABP4-201ENST00000375249 SOGA1O94964 1423 aa31.43■■■□□ 2.62
HABP4-201ENST00000375249 NACADO15069 1562 aa31.38■■■□□ 2.61
HABP4-201ENST00000375249 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
HABP4-201ENST00000375249 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.37■■■□□ 2.61
HABP4-201ENST00000375249 EEA1Q15075 1411 aa31.34■■■□□ 2.61
HABP4-201ENST00000375249 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
HABP4-201ENST00000375249 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.29■■■□□ 2.6
HABP4-201ENST00000375249 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.22■■■□□ 2.59
HABP4-201ENST00000375249 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
HABP4-201ENST00000375249 GOLGA3Q08378 1498 aa31.21■■■□□ 2.59
HABP4-201ENST00000375249 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
HABP4-201ENST00000375249 SMARCA2P51531 1590 aa31.1■■■□□ 2.57
HABP4-201ENST00000375249 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.01■■■□□ 2.55
HABP4-201ENST00000375249 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.97■■■□□ 2.55
HABP4-201ENST00000375249 CLIP1P30622 1438 aa30.94■■■□□ 2.54
HABP4-201ENST00000375249 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.93■■■□□ 2.54
HABP4-201ENST00000375249 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.92■■■□□ 2.54
HABP4-201ENST00000375249 SMARCA4P51532 1647 aa30.88■■■□□ 2.53
HABP4-201ENST00000375249 APLP2Q06481 763 aa30.88■■■□□ 2.53
HABP4-201ENST00000375249 KIF21BO75037 1637 aa30.82■■■□□ 2.52
HABP4-201ENST00000375249 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HABP4-201ENST00000375249 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
HABP4-201ENST00000375249 BCL11AQ9H165 835 aa30.68■■■□□ 2.5
HABP4-201ENST00000375249 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.59■■■□□ 2.49
HABP4-201ENST00000375249 SYNJ1O43426 1573 aa30.57■■■□□ 2.48
HABP4-201ENST00000375249 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
HABP4-201ENST00000375249 KCNH8Q96L42 1107 aa30.5■■■□□ 2.47
HABP4-201ENST00000375249 BCANQ96GW7 911 aa30.46■■■□□ 2.47
HABP4-201ENST00000375249 FKBP8Q14318 412 aa30.41■■■□□ 2.46
HABP4-201ENST00000375249 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
HABP4-201ENST00000375249 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
HABP4-201ENST00000375249 CUX2O14529 1486 aa30.35■■■□□ 2.45
HABP4-201ENST00000375249 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
HABP4-201ENST00000375249 ARAP1Q96P48 1450 aa30.28■■■□□ 2.44
HABP4-201ENST00000375249 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.2■■■□□ 2.43
HABP4-201ENST00000375249 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.2■■■□□ 2.43
HABP4-201ENST00000375249 NEFLP07196 543 aa30.19■■■□□ 2.42
HABP4-201ENST00000375249 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.18■■■□□ 2.42
HABP4-201ENST00000375249 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
HABP4-201ENST00000375249 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.15■■■□□ 2.42
HABP4-201ENST00000375249 PRXQ9BXM0 1461 aa30.13■■■□□ 2.41
HABP4-201ENST00000375249 MAPKBP1O60336 1514 aa30.11■■■□□ 2.41
HABP4-201ENST00000375249 ITGAEP38570 1179 aa30.09■■■□□ 2.41
HABP4-201ENST00000375249 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.09■■■□□ 2.41
HABP4-201ENST00000375249 TOP2BQ02880 1626 aa30.06■■■□□ 2.4
HABP4-201ENST00000375249 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
HABP4-201ENST00000375249 CCER2I3L3R5 266 aa30■■■□□ 2.39
HABP4-201ENST00000375249 MSH5O43196 834 aa29.99■■■□□ 2.39
HABP4-201ENST00000375249 TRIM52Q96A61 297 aa29.99■■■□□ 2.39
HABP4-201ENST00000375249 WDR97A6NE52 1622 aa29.98■■■□□ 2.39
HABP4-201ENST00000375249 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.385e-7■■□□□ 13.9
HABP4-201ENST00000375249 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.91■■■□□ 2.38
HABP4-201ENST00000375249 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.91■■■□□ 2.38
HABP4-201ENST00000375249 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms