Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18Q15532 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18Q15532 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18Q15532 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SS18Q15532 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SS18Q15532 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18Q15532 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18Q15532 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18Q15532 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18Q15532 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18Q15532 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18Q15532 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18Q15532 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18Q15532 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18Q15532 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18Q15532 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18Q15532 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18Q15532 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SS18Q15532 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18Q15532 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18Q15532 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18Q15532 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SS18Q15532 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SS18Q15532 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SS18Q15532 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SS18Q15532 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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