Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H3F3AP84243 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H3F3AP84243 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H3F3AP84243 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms