Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD34P28906 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD34P28906 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD34P28906 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD34P28906 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD34P28906 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD34P28906 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD34P28906 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD34P28906 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD34P28906 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD34P28906 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD34P28906 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD34P28906 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD34P28906 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD34P28906 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD34P28906 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD34P28906 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD34P28906 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD34P28906 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD34P28906 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD34P28906 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD34P28906 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD34P28906 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CD34P28906 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD34P28906 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD34P28906 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD34P28906 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 978.1 ms