Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RXRAP19793 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRAP19793 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRAP19793 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRAP19793 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRAP19793 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRAP19793 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRAP19793 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRAP19793 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RXRAP19793 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRAP19793 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRAP19793 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RXRAP19793 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRAP19793 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRAP19793 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRAP19793 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRAP19793 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRAP19793 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRAP19793 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRAP19793 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RXRAP19793 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRAP19793 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RXRAP19793 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RXRAP19793 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRAP19793 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRAP19793 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRAP19793 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRAP19793 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRAP19793 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRAP19793 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRAP19793 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRAP19793 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRAP19793 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRAP19793 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRAP19793 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRAP19793 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRAP19793 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRAP19793 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRAP19793 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RXRAP19793 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRAP19793 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXRAP19793 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RXRAP19793 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RXRAP19793 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXRAP19793 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXRAP19793 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RXRAP19793 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RXRAP19793 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RXRAP19793 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RXRAP19793 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RXRAP19793 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRAP19793 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms