Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 POLRMT-208ENST00000592863 966 ntTSL 520.98■□□□□ 0.951e-34■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.946e-12■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.6■□□□□ 0.891e-34■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-212ENST00000477914 2063 ntTSL 520.04■□□□□ 0.86e-12■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-210ENST00000467491 2131 ntTSL 518.97■□□□□ 0.636e-12■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.451e-34■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.181e-34■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 MINDY3-206ENST00000477891 2307 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.581e-12■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 MINDY3-203ENST00000418767 967 ntTSL 310.43□□□□□ -0.741e-12■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 MINDY3-201ENST00000277632 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.851e-12■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 POLR2J4-201ENST00000422304 974 ntTSL 29.47□□□□□ -0.891e-34■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 MINDY3-204ENST00000436829 618 ntTSL 59□□□□□ -0.971e-12■■■■■ 428.5
UTP3Q9NQZ2 STRN4-215ENST00000597063 570 ntTSL 419.43■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 427.3
UTP3Q9NQZ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.732e-26■■■■■ 424.8
UTP3Q9NQZ2 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 29.18□□□□□ -0.941e-10■■■■■ 423.9
UTP3Q9NQZ2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 423.9
UTP3Q9NQZ2 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 423.9
UTP3Q9NQZ2 CREBRF-206ENST00000523161 559 ntTSL 416.86■□□□□ 0.293e-55■■■■■ 423
UTP3Q9NQZ2 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.233e-55■■■■■ 423
UTP3Q9NQZ2 CREBRF-205ENST00000522692 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.743e-55■■■■■ 423
UTP3Q9NQZ2 CREBRF-204ENST00000520464 5163 ntTSL 29.59□□□□□ -0.873e-55■■■■■ 423
UTP3Q9NQZ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.961e-16■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.028e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.427e-25■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-206ENST00000476949 382 ntTSL 215.97■□□□□ 0.157e-25■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.047e-25■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.117e-25■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD5-205ENST00000471789 567 ntTSL 212.22□□□□□ -0.457e-25■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-218ENST00000635420 581 ntTSL 311.15□□□□□ -0.628e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-212ENST00000634591 740 ntTSL 510.16□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-215ENST00000635047 760 ntTSL 49.98□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-217ENST00000635175 1464 ntTSL 27.75□□□□□ -1.178e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-204ENST00000425198 6952 ntTSL 57.48□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.348e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-213ENST00000634600 583 ntTSL 25.93□□□□□ -1.468e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT7-208ENST00000475109 733 ntTSL 55.91□□□□□ -1.468e-7■■■■■ 422.3
UTP3Q9NQZ2 PKP3-211ENST00000534401 756 ntTSL 322.7■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 421.6
UTP3Q9NQZ2 PKP3-209ENST00000533069 590 ntTSL 217.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 421.6
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-204ENST00000420847 1064 ntTSL 510.1□□□□□ -0.793e-23■■■■■ 421.6
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 420.8
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-202ENST00000563668 1509 ntTSL 218.15■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 420.8
UTP3Q9NQZ2 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 420.2
UTP3Q9NQZ2 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 420.2
UTP3Q9NQZ2 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 420.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-208ENST00000527680 569 ntTSL 223.71■■□□□ 1.391e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-210ENST00000531290 1135 ntTSL 223.61■■□□□ 1.371e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-203ENST00000447216 980 ntTSL 219.42■□□□□ 0.71e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 HERC1-207ENST00000560316 577 ntTSL 417.53■□□□□ 0.41e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.21e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-205ENST00000525079 768 ntTSL 313.75□□□□□ -0.211e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.351e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-211ENST00000533012 817 ntTSL 212.05□□□□□ -0.481e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-201ENST00000359005 849 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.81e-22■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP2-206ENST00000475769 375 ntTSL 39.14□□□□□ -0.951e-25■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 ITCH-206ENST00000486883 703 ntTSL 28.71□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 419.2
UTP3Q9NQZ2 TRMU-208ENST00000463785 557 ntTSL 416.71■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 417.5
UTP3Q9NQZ2 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.86□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 417.4
UTP3Q9NQZ2 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.075e-9■■■■■ 416.9
UTP3Q9NQZ2 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.175e-9■■■■■ 416.9
UTP3Q9NQZ2 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.275e-9■■■■■ 416.9
UTP3Q9NQZ2 GOLGB1-205ENST00000482512 10295 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.285e-9■■■■■ 416.9
UTP3Q9NQZ2 PGD-204ENST00000477958 508 ntTSL 317.71■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 416.7
UTP3Q9NQZ2 APBA3-206ENST00000590238 830 ntTSL 517.18■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 416.7
UTP3Q9NQZ2 PSMC4-204ENST00000596386 929 ntTSL 216.57■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 416.1
UTP3Q9NQZ2 SF1-217ENST00000486960 719 ntTSL 27.04□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 412.3
UTP3Q9NQZ2 ASCC3-205ENST00000468245 1227 ntTSL 216.44■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 410.5
UTP3Q9NQZ2 ASCC3-202ENST00000324723 852 ntTSL 316.16■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 410.5
UTP3Q9NQZ2 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 410.5
UTP3Q9NQZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.185e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 COX6B2-203ENST00000587357 494 ntTSL 428.03■■■□□ 2.085e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.915e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.795e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-207ENST00000445181 873 ntTSL 325.63■■□□□ 1.695e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 DBP-203ENST00000594723 5756 ntTSL 225.37■■□□□ 1.655e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.645e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 MAP3K10-207ENST00000597986 2104 ntTSL 525.16■■□□□ 1.625e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.535e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.535e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-216ENST00000478603 802 ntTSL 224.26■■□□□ 1.475e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.455e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-209ENST00000460573 443 ntTSL 523.98■■□□□ 1.435e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 FAM47E-STBD1-201ENST00000509377 1484 ntTSL 223.94■■□□□ 1.425e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.415e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.395e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.365e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.345e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.325e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 FAM47E-STBD1-203ENST00000514365 1465 ntTSL 222.91■■□□□ 1.265e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.255e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PCSK4-205ENST00000586616 2855 ntTSL 222.51■■□□□ 1.195e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.165e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 PCSK4-207ENST00000588195 1806 ntTSL 222.13■■□□□ 1.135e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.125e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.15e-17■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 MAP3K10-205ENST00000594791 899 ntTSL 321.66■■□□□ 1.065e-17■■■■■ 409.9
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