Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.561e-323■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.541e-323■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.041e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-323■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-204ENST00000610481 353 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC11.48□□□□□ -0.571e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 210.2□□□□□ -0.781e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 29.93□□□□□ -0.821e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.821e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 29.65□□□□□ -0.861e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.021e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC8.06□□□□□ -1.121e-323■■□□□ 12.4
UTP3Q9NQZ2 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 27.96□□□□□ -1.141e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.191e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.241e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 26.94□□□□□ -1.31e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-201ENST00000535076 849 ntTSL 26.6□□□□□ -1.351e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.371e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.451e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.531e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.551e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.591e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.931e-323■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.081e-323■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.811e-323■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 59.22□□□□□ -0.932e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.792e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.133e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 315.88■□□□□ 0.133e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 215.68■□□□□ 0.13e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-207ENST00000599787 660 ntTSL 320.44■□□□□ 0.862e-81■■■■■ 987.5
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-204ENST00000593647 2691 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.852e-81■■■■■ 987.5
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-206ENST00000598762 225 ntTSL 39.44□□□□□ -0.92e-81■■■■■ 987.5
UTP3Q9NQZ2 PIGG-216ENST00000508669 584 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-80■■■■■ 768.1
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 520.95■□□□□ 0.941e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 219■□□□□ 0.631e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 511.17□□□□□ -0.621e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.231e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.891e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-208ENST00000618509 582 ntTSL 414.63□□□□□ -0.072e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-211ENST00000622332 754 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-203ENST00000467245 1158 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.782e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-201ENST00000356906 978 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.12e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.694e-71■■■■■ 729.8
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UTP3Q9NQZ2 HADHB-201ENST00000317799 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.364e-71■■■■■ 729.8
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UTP3Q9NQZ2 HADHB-207ENST00000494615 2883 ntTSL 27.74□□□□□ -1.174e-71■■■■■ 729.8
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UTP3Q9NQZ2 PSMC5-210ENST00000581764 2107 ntTSL 520.07■□□□□ 0.83e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-213ENST00000582130 828 ntTSL 316.26■□□□□ 0.193e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-205ENST00000579147 2586 ntTSL 215.42■□□□□ 0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-217ENST00000584536 804 ntTSL 515.41■□□□□ 0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-214ENST00000582420 394 ntTSL 415.08■□□□□ 03e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-220ENST00000585123 899 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-216ENST00000584320 804 ntTSL 514.59□□□□□ -0.073e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-206ENST00000579708 558 ntTSL 411.39□□□□□ -0.593e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-221ENST00000585242 1178 ntTSL 510.46□□□□□ -0.733e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-211ENST00000581842 809 ntTSL 510.42□□□□□ -0.743e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 JDP2-206ENST00000559060 631 ntTSL 327.03■■□□□ 1.921e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.071e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.031e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 NMT1-205ENST00000587120 573 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.591e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 MITF-213ENST00000461511 574 ntTSL 411.19□□□□□ -0.621e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 RPS6KA4-207ENST00000532496 588 ntTSL 514.87□□□□□ -0.033e-68■■■■■ 269.2
UTP3Q9NQZ2 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.126e-68■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.234e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.094e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.124e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-207ENST00000486740 689 ntTSL 310.61□□□□□ -0.714e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-209ENST00000602463 561 ntTSL 49.96□□□□□ -0.824e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-204ENST00000466098 689 ntTSL 39.53□□□□□ -0.884e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-208ENST00000602366 573 ntTSL 47.23□□□□□ -1.254e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 RHEB-203ENST00000470370 501 ntTSL 57.71□□□□□ -1.184e-65■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RHEB-202ENST00000470072 764 ntTSL 47.04□□□□□ -1.284e-65■■■■■ 409.9
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