Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.561e-323■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.541e-323■□□□□ 10.5
UTP3Q9NQZ2 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.041e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.121e-323■□□□□ 11.1
UTP3Q9NQZ2 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-204ENST00000610481 353 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC11.48□□□□□ -0.571e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 210.2□□□□□ -0.781e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 29.93□□□□□ -0.821e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.821e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 29.65□□□□□ -0.861e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.021e-323■□□□□ 10
UTP3Q9NQZ2 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC8.06□□□□□ -1.121e-323■■□□□ 12.4
UTP3Q9NQZ2 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 27.96□□□□□ -1.141e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.191e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.241e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 26.94□□□□□ -1.31e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-201ENST00000535076 849 ntTSL 26.6□□□□□ -1.351e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.371e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.451e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.531e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.551e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.591e-323■■□□□ 13.7
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.931e-323■■■■□ 24.7
UTP3Q9NQZ2 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.081e-323■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.811e-323■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 59.22□□□□□ -0.932e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.792e-129■■■■■ 884.5
UTP3Q9NQZ2 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.133e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 315.88■□□□□ 0.133e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 215.68■□□□□ 0.13e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.63e-103■■■■□ 24.9
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-207ENST00000599787 660 ntTSL 320.44■□□□□ 0.862e-81■■■■■ 987.5
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-204ENST00000593647 2691 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.852e-81■■■■■ 987.5
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-206ENST00000598762 225 ntTSL 39.44□□□□□ -0.92e-81■■■■■ 987.5
UTP3Q9NQZ2 PIGG-216ENST00000508669 584 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-80■■■■■ 768.1
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 520.95■□□□□ 0.941e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 219■□□□□ 0.631e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-205ENST00000468019 941 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-207ENST00000489392 966 ntTSL 511.17□□□□□ -0.621e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-204ENST00000463740 1164 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.231e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.891e-79■□□□□ 10.2
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-208ENST00000618509 582 ntTSL 414.63□□□□□ -0.072e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-211ENST00000622332 754 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-203ENST00000467245 1158 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.782e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-201ENST00000356906 978 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.12e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.694e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.234e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-201ENST00000317799 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.364e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-202ENST00000405867 1588 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.514e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-207ENST00000494615 2883 ntTSL 27.74□□□□□ -1.174e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-203ENST00000578570 1680 ntTSL 222.85■■□□□ 1.253e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-215ENST00000583283 602 ntTSL 421.21■□□□□ 0.993e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-210ENST00000581764 2107 ntTSL 520.07■□□□□ 0.83e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-213ENST00000582130 828 ntTSL 316.26■□□□□ 0.193e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-205ENST00000579147 2586 ntTSL 215.42■□□□□ 0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-217ENST00000584536 804 ntTSL 515.41■□□□□ 0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-214ENST00000582420 394 ntTSL 415.08■□□□□ 03e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-220ENST00000585123 899 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-216ENST00000584320 804 ntTSL 514.59□□□□□ -0.073e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-206ENST00000579708 558 ntTSL 411.39□□□□□ -0.593e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-221ENST00000585242 1178 ntTSL 510.46□□□□□ -0.733e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-211ENST00000581842 809 ntTSL 510.42□□□□□ -0.743e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 JDP2-206ENST00000559060 631 ntTSL 327.03■■□□□ 1.921e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.071e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.031e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 NMT1-205ENST00000587120 573 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.591e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 MITF-213ENST00000461511 574 ntTSL 411.19□□□□□ -0.621e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 RPS6KA4-207ENST00000532496 588 ntTSL 514.87□□□□□ -0.033e-68■■■■■ 269.2
UTP3Q9NQZ2 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.126e-68■□□□□ 9.9
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.234e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.094e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.124e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-207ENST00000486740 689 ntTSL 310.61□□□□□ -0.714e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-209ENST00000602463 561 ntTSL 49.96□□□□□ -0.824e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-204ENST00000466098 689 ntTSL 39.53□□□□□ -0.884e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-208ENST00000602366 573 ntTSL 47.23□□□□□ -1.254e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 RHEB-203ENST00000470370 501 ntTSL 57.71□□□□□ -1.184e-65■■■■■ 409.9
UTP3Q9NQZ2 RHEB-202ENST00000470072 764 ntTSL 47.04□□□□□ -1.284e-65■■■■■ 409.9
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